Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R2P2-201ENST00000440405 613 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093334.1-201ENST00000559904 423 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011472.3-201ENST00000586051 906 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359643.3-201ENST00000606761 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIR2DL1-202ENST00000336077 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS27-205ENST00000513900 1369 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL022322.1-201ENST00000609162 1433 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009061.2-203ENST00000635000 1462 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 BET1-205ENST00000433727 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073551.1-201ENST00000450741 834 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD33B-AS1-201ENST00000506304 522 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116359.1-201ENST00000510731 1099 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 C12orf73-206ENST00000547975 1243 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013451.2-201ENST00000556652 667 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099518.5-201ENST00000567236 1137 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-4Q9BYQ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms