Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GSDMCQ9BYG8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms