Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5DQ9BY66 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KDM5DQ9BY66 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms