Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AGMATQ9BSE5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AGMATQ9BSE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms