Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMKK2Q96RR4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMKK2Q96RR4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms