Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHAMP1Q96JM3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHAMP1Q96JM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms