Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBM17Q96I25 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms