Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms