Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3BQ7Z3V4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms