Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PREX2Q70Z35 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PREX2Q70Z35 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms