Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TPGS1Q6ZTW0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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