Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q6P435 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q6P435 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q6P435 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q6P435 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q6P435 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms