Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Sox19Q62249 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox19Q62249 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox19Q62249 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox19Q62249 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox19Q62249 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox19Q62249 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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