Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR78Q5VTH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR78Q5VTH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms