Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NHSL1Q5SYE7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NHSL1Q5SYE7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms