Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HFEQ30201 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HFEQ30201 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HFEQ30201 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms