Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUM3Q15397 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUM3Q15397 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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