Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCOLCEQ15113 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCOLCEQ15113 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms