Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HNF4GQ14541 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HNF4GQ14541 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms