Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLD1Q13393 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLD1Q13393 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms