Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF3Q13114 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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