Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN12Q05209 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms