Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK6Q00534 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK6Q00534 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms