Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD3P84022 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD3P84022 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMAD3P84022 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD3P84022 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD3P84022 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD3P84022 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD3P84022 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms