Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB1P54762 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB1P54762 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB1P54762 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHB1P54762 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHB1P54762 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms