Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms