Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD10P28358 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms