Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRAP18433 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRAP18433 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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