Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARF4P18085 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARF4P18085 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF4P18085 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARF4P18085 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms