Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPTA1P02549 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTA1P02549 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms