Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD3O95983 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms