Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLOT1O75955 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms