Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPLO60437 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPLO60437 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPLO60437 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPLO60437 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPLO60437 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPLO60437 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPLO60437 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPLO60437 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPLO60437 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPLO60437 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPLO60437 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPLO60437 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPLO60437 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms