Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SETD1AO15047 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms