Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERVV-2B6SEH9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms