Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NRF1Q16656 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms