Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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