Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
R3HDM1Q15032 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
R3HDM1Q15032 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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