Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SMCO1Q147U7 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SMCO1Q147U7 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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