Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms