Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms