Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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