Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms