Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms