Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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