Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HLA-DQB1P01920 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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