Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms