Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC099687.1-201ENST00000531798 510 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC006238.1-201ENST00000609787 534 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PSG9-205ENST00000443718 1421 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 DCLRE1C-203ENST00000378242 1933 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM5-208ENST00000615021 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CD44-205ENST00000352818 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P24-201ENST00000433516 273 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ACTP1-201ENST00000440793 383 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TIMMDC1Q9NPL8 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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TIMMDC1Q9NPL8 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC008870.2-201ENST00000568262 1024 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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