Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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TM6SF1Q9BZW5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
TM6SF1Q9BZW5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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TM6SF1Q9BZW5 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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TM6SF1Q9BZW5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
TM6SF1Q9BZW5 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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