Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CLDN19Q8N6F1 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CLDN19Q8N6F1 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CLDN19Q8N6F1 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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CLDN19Q8N6F1 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CLDN19Q8N6F1 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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